Alpha-Seite, die geheime außerirdische Basis der Erde, wird von den Goa‘Uld ausfindig gemacht und angegriffen. Bei der darauf folgenden Evakuierung und Selbstzerstörung der Basis verschwinden 90 Leute der Besatzung, unter ihnen Major Carter, die sich auf Alpha-Seite befand um einen neuen Waffen-Prototyp zu entwickeln.
Teal‘c und Jack machen sich auf die Suche nach ihr, nicht wissend, ob sie überhaupt noch am Leben ist.
Ein außerirdischer Roboter plant, die Erde anzugreifen ...Susan wird an ihrem Hochzeitstag plötzlich von einem Meteoriten getroffen und mit der Substanz Quantonium verstrahlt, die sie auf 15 Meter anwachsen lässt. Das alarmierte Militär nimmt Susan fest und bringt sie in die geheime Regierungsanlage des Generals Monger, wo weitere Monster inhaftiert sind: Insektosaurus, B.O.B., Missing Link... Monsters vs. Aliens
